生殖器皰疹是由單純皰疹病毒（HSV）感染所引起。單純皰疹病毒分為兩型即HSV-1和HSV-2。HSV-1通過呼吸道、皮膚和粘膜密切接觸傳染，主要引起口唇、咽、眼及皮膚感染，少數(shù)（約8%）亦可引起生殖器感染。HSV-2則是生殖器皰疹的主要病原體（88%），存在于皮膚和粘膜損害的滲出液、精液、前列腺分泌液、宮頸、陰道分泌液中，主要通過性生活傳染，引起原發(fā)性生殖器皰疹。皮損多發(fā)于男性的包皮、龜頭、冠狀溝和陰莖等處，偶見于尿道口；女性則多見于大小陰唇、陰蒂、陰阜、子宮頸等處，亦見于尿道口。原發(fā)性生殖器皰疹，往往伴有全身不適，低熱、頭痛等全身癥狀，局部淋已結腫大。

生殖器皰疹從感染到發(fā)病一般為3-5天，患處先有燒灼感，然后出現(xiàn)紅斑，繼之在紅斑的基礎上發(fā)生多群紅色丘疹，并感到熱癢，不久即可變成小水庖，數(shù)日后水皰變?yōu)槟撔裕坪罂尚纬擅訝€，最后可結痂痊愈。整個病程15-20天。這是生殖器皰疹的主要生殖器皰疹的早期癥狀表現(xiàn)。

男性生殖器皰疹，多生于龜頭、冠狀溝、包皮、陰莖體、尿道口和陰囊。男性同性戀者由于肛交，皰疹可發(fā)生于肛門及肛周，嚴重者可感染直腸。男性同時可并發(fā)尿道炎、膀胱炎和前列腺炎；女性可并發(fā)宮頸炎和子宮炎。大多數(shù)生殖器皰疹患者還可并發(fā)雙側腹股溝淋巴結腫大。

最常見的生殖器皰疹的早期癥狀表現(xiàn)是一簇包含有流動性液體的大水皰，破裂后會產(chǎn)生疼痛的潰瘍，潰瘍之后結痂然后自愈。這個過程可能會持續(xù)好幾天。但是在有些人只表現(xiàn)為皮膚上有一些小疹子和類似丘疹的小腫塊。還有些人有一些其他的癥狀像小便澀痛，在一些女性中可以表現(xiàn)為有陰道液體排出。