本病的發(fā)病機制較為復雜，與遺傳、免疫和對生理藥理介質(zhì)反應(yīng)異常有關(guān)，環(huán)境因素在本病發(fā)生中也起著相當重要的作用。約70%患者家族中有遺傳過敏性皮炎、哮喘或過敏性鼻炎等遺傳過敏史。

雙親均有遺傳過敏史，其子女發(fā)生遺傳過敏性疾病的機會比雙親中只有一方有遺傳過敏史的要高。近來發(fā)現(xiàn)染色體11ql3部位的基因與本病的過敏性哮喘的發(fā)病相關(guān)。在免疫異常方面表現(xiàn)為血IgE增高，近來研究指出皮膚朗格漢斯細胞具有高親和力IgEFc受體（FceRI）。

“吸入性”抗原進入遺傳過敏性皮炎的皮膚，引起朗格漢斯細胞的活化，釋放IL-1β使異位性特異的T輔助細胞亞類TH-2活化而產(chǎn)生IL-4、IL-5等細胞因子，刺激B細胞產(chǎn)生IgE，同時IL-5是人嗜酸性白細胞分化與增生的重要細胞因子。

在遺傳過敏性皮炎患者中，由環(huán)境變應(yīng)原（屋塵螨，花粉）斑試引起的濕疹樣皮膚反應(yīng)的表現(xiàn)與皮膚遲發(fā)相反應(yīng)（cutaneouslate-phasereaction）相似。

在皮損中有嗜酸性白細胞浸潤，故認為IgE介導的“接觸性過敏”，在遺傳過敏性皮炎的發(fā)病機制中起了重要作用。

生理藥理學方面，患者白細胞和表皮細胞對β腎上腺素能性激動劑的反應(yīng)遲鈍，所產(chǎn)生的cAMP水平及抑制表皮細胞核分裂功能降低，β腎上腺素能性受體與β興奮劑親和力下降，a腎上腺素能性受體比率增高等。此外尚發(fā)現(xiàn)單一核細胞內(nèi)cAMB磷酸二酯酶（PDE）活性增高，從而使cAMP水平下降。