一般來說通過敏感的檢測方法，可在患者血清、淋巴細胞和（或）肝組織中檢測到乙肝病毒DNA。經肝穿刺檢查，在肝組織中不但能找到乙肝表面抗原和（或）乙肝核心抗原，還有可能發(fā)現不同程度的炎癥或纖維化。

目前越來越多資料和研究表明，無論是急性自限性肝炎，還是成功進行抗乙肝病毒治療后慢性乙肝患者，乙肝表面抗原清除后部分患者肝組織中仍可檢出乙肝病毒DNA，肝臟損害并沒有停止，仍可發(fā)生肝硬化或肝癌，這種情況稱作隱匿性乙肝病毒感染。

一、臨床上，約有20%的隱匿性慢性乙肝患者病人除了乙肝病毒陽性之外，其余的乙肝病毒血清標志均為陰性，對此應該加以注意，另外，在診斷時，還需要排除由其他病毒和非病毒因素等所引起的肝損傷。

二、對于長期原因不明的肝炎、肝硬化，應想到存在隱匿性乙肝的可能。丙肝患者通過治療，HCV-RNA已完全清除，但ALT（丙氨酸轉氨酶）仍升高且不能用其他原因解釋（脂肪肝、藥物肝損害等）者，可能存在隱匿性乙肝。

三、如果慢性乙肝病毒攜帶者的血清乙肝表面抗原雖為陰性，但血清和肝組織中的乙肝病毒為陽性，并有慢性乙肝的臨床表現，乙肝患者可伴有血清乙肝表面抗體，乙肝e抗體，和乙肝核心抗體陽性者，就可以診斷為隱匿性慢性乙肝。