發(fā)作性睡病病因不甚明了，可能與腦干網狀結構上行激活系統功能降低或橋腦尾側網狀核功能亢進有關，也有研究認為系常染色體顯性遺傳性疾病，盡管在某些種族如日本人中發(fā)生率較高，但各種族和世界各地均有病例報告，在各種群中其遺傳特征均與人HLA最小組織相關基因（DR和DQ位點）密切相關，發(fā)病機制為REM睡眠的調節(jié)障礙，對緊隨在NREM睡眠周期后的REM睡眠的控制喪失，不論在睡眠開始還是在清醒期，進入REM睡眠的傾向均增加。

腦外傷等疾?。?5%）：

Sandyk（1995）認為：松果體及其分泌褪黑素的功能失?？赡芘c本病的發(fā)生有關，也有人認為可能與腦外傷，病毒感染，免疫功能紊亂，腦腫瘤，多發(fā)性硬化等疾病有關，正常REM睡眠的發(fā)生有賴于腦干縫際核5-羥色胺系統對其他遞質系統的觸發(fā)，而此種觸發(fā)的節(jié)律失調可發(fā)生本病。

遺傳（20%）：

Yoss于1960年報告，在1個家族的3代中有12例（7男5女）發(fā)病者，動物實驗顯示，當狗的雙親均為發(fā)作性睡病時，所有一窩小狗都受影響，而這些狗和無血緣關系或血緣關系較遠的狗交配繁殖的小狗不受影響，傳遞的模式可能是常染色體隱性遺傳，但同時發(fā)現，并不是所有種類的狗都顯示出發(fā)作性睡病的遺傳學傳遞，可能存在不同的病因。

環(huán)境因素（15%）：

Honda等報告，日本的發(fā)作性睡病患者100%表現出人類白細胞抗原HLA-DR2陽性，歐洲和美洲的學者也證實，大多數白種人發(fā)作性睡病患者為HLA-DR2，DQWl，DW2陽性，但Guilleminault等認為：發(fā)作性睡病的傳遞是多因素的，而且環(huán)境因素也起著重要的作用。