引起慢性結腸炎的病因有很多，具體如下：

1、過敏因素

過敏性病變，受個體差異影響。主要是腸道性過敏，也時有累及皮膚。有些人對魚類、蝦、蟹、牛乳等高蛋白食物產(chǎn)生過敏，這些都是異體蛋白進入人體時所產(chǎn)生大量組織胺物質(zhì)，引發(fā)過敏性反應。過敏性反應，是受致敏物質(zhì)刺激，自身免疫引起反應，釋放出自衛(wèi)物質(zhì)而激發(fā)大量免疫細胞凝聚、均結集在消化道粘膜表面，從而引起粘膜表面水腫充血及滲液等炎癥發(fā)生。過敏性反應是隨著人類生活、飲食習慣的改變，個體的差異，是消化過敏的主要因素。

2、感染因素

感染，在結腸炎病因中是主要病因之一。雖然在糞便中未能檢致病菌、病毒或真菌。每當發(fā)病時，使用抗生素則有不同程度控病情和治療效果，這說明抗生素具有抑制大腸桿菌及其它致病菌，可減低臨床癥狀，一般認為都與感染有關。人類是雜食性的，當吃了不潔或變質(zhì)的食物，往往會發(fā)生腸道病變，是占結腸炎病因多數(shù)。

3、自身免疫

隨著社會發(fā)展，醫(yī)學的進步，免疫學的快速成長，有很多不明病因的都以探明。目前，免疫疾的發(fā)病率高，治療困難，已引起重視。因此，慢性結腸炎在常規(guī)治療是下難以治愈的。