當(dāng)大三陽患者的機(jī)體功能被激活時(shí)，系統(tǒng)能識(shí)別出乙肝病毒的抗原物質(zhì)和受病毒感染的肝并出現(xiàn)清除病毒的反應(yīng)，這是機(jī)體的一種自身保護(hù)反應(yīng)。其結(jié)果是大量病毒被清除，而同時(shí)受感染的肝也遭到破壞，出現(xiàn)轉(zhuǎn)氨酶升高，有時(shí)還會(huì)出現(xiàn)膽紅素的升高（即黃疸）。

但這種清除常常是不的，對(duì)于非復(fù)制狀態(tài)的病毒常常不能殺而呈潛伏狀態(tài)。當(dāng)機(jī)體力下降時(shí)，病毒又重新開始復(fù)制，感染新的肝，并導(dǎo)致新一輪的攻擊。

如此反復(fù)清除、破壞，再清除、再破壞的過程，是慢性肝炎發(fā)展的過程。隨著血液中病毒的清除，血清中抗-HBe出現(xiàn)，HBeAg消失，也從大三陽轉(zhuǎn)成了小三陽。由此可見，能從大三陽轉(zhuǎn)成小三陽，對(duì)大分的乙型肝炎病人（感染變異病毒者除外）來說象征著體內(nèi)病毒復(fù)制的下降，病毒數(shù)量的減少，有時(shí)血液中甚至檢測不到病毒。

雖然大三陽或小三陽與肝臟損傷的嚴(yán)重程度不直接相關(guān)，但病毒減少時(shí)受感染的肝會(huì)減少，反應(yīng)和肝損傷也會(huì)減輕，因此我們?cè)谥委熤锌傁Ｍ軐⒋笕栟D(zhuǎn)成小三陽，使病毒的復(fù)制下降到低水平，這樣對(duì)病人是有利的。