臨床表現(xiàn)的多樣性給多系統(tǒng)萎縮的診斷帶來很大困難，生前診斷依據(jù)臨床表現(xiàn)，而且僅能作出可能或疑似診斷，確診需病理證實。但有研究認為明顯的自主神經(jīng)障礙、早期小腦癥狀體征、步態(tài)異常和強直、認知障礙的缺乏及對左旋多巴治療的無反應性為診斷本病的有利指征，特別是對左旋多巴治療的無反應性。

1999年Gilman（美國）等提出了多系統(tǒng)萎縮的四組臨床特征和診斷標準。經(jīng)尸檢證實此診斷標準有早期診斷價值及很高的臨床診斷準確性。

四組臨床特征是：

①自主神經(jīng)功能障礙或排尿功能障礙。

②帕金森樣癥狀。

③小腦性共濟失調。

④錐體系統(tǒng)功能障礙。

Gilman診斷標準如下。

①可能的多系統(tǒng)萎縮，其中一組臨床特征加上另外兩個分屬不同系統(tǒng)的體征。

②很可能多系統(tǒng)萎縮，第一組臨床特征加上對多巴胺反應差的帕金森樣癥狀或小腦性共濟失調。

③確診多系統(tǒng)萎縮需經(jīng)神經(jīng)病理學證實。

鑒別診斷：

在本病的不同階段，尚需注意與帕金森病、進行性核上性麻痹、皮質基底節(jié)變性、伴有Lewy小體的癡呆、排尿性暈厥，神經(jīng)癥、脊髓小腦變性、多發(fā)性硬化等疾病鑒別。