瓶頸一：藥物排石，改善癥狀不除石。此方法只適合于泌尿系結(jié)石小于0.5厘米、且無泌尿系狹窄的患者，及膽系結(jié)石小于0.3厘米的且無慢性炎癥的患者。但結(jié)石患者多數(shù)伴有感染，這會加重梗阻。故藥物往往只能改善癥狀。如原有的生活方式、飲食習慣沒有改變，結(jié)石仍會悄悄生長。當再一次出現(xiàn)癥狀時，結(jié)石通常長大了許多，讓患者錯過了最佳的治療時機。

瓶頸二：手術取石，除了結(jié)石傷了身。不論是傳統(tǒng)的膽囊切除術、膽總管切開取石、部分肝葉（含有結(jié)石的）切除術、腎切開取石術、輸尿管切開取石術等取石術，還是腹腔鏡取石，只要是手術，便意味著要不可避免地帶來創(chuàng)傷。傳統(tǒng)手術取石切口大、損傷大、危險大，而且恢復時間長；腹腔鏡手術的切口雖較小，但要求較高，對多發(fā)結(jié)石、有慢性炎癥的結(jié)石均不適合。

瓶頸三：排石不當，痛苦大、危害多。泌尿系結(jié)石的藥物排石，如結(jié)石表面不光滑，有銳利的毛刺，在輸尿管中滑行時，強行排石就會嚴重損傷輸尿管，同時患者疼痛難忍；膽系結(jié)石中結(jié)石直徑較大者，如直接采取藥物排石會引起結(jié)石嵌頓于膽囊頸部、膽囊管及膽管內(nèi)，不但結(jié)石排不出，反而加重患者的痛苦，有的還會出現(xiàn)嚴重的并發(fā)癥。

瓶頸四：取石不盡，損傷大、易復發(fā)。手術取石有很高的殘石率，結(jié)石一般取不盡。如腎結(jié)石取石，對長在腎門處、伸展于腎盞的結(jié)石，因手術無法取盡，多建議患者切除腎臟；肝內(nèi)膽管結(jié)石合并化膿膽管炎時，要做含有結(jié)石的部分肝葉手術切除術，而對于其周圍仍存在散在的、小的膽管結(jié)石，仍無法手術解決。