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HSV-2感染主要發(fā)生于生殖器部位，患部先有燒灼感，很快在紅斑的基礎(chǔ)上發(fā)生成群的小水皰，多見(jiàn)男性包皮、龜頭、冠狀溝、陰莖等處，偶見(jiàn)于尿道;本病一般經(jīng)過(guò)3周左右可以痊愈，但常有反復(fù)發(fā)作，一般原發(fā)疹后1-4個(gè)月內(nèi)復(fù)發(fā)，癥狀較原發(fā)者輕，范圍亦小，局限于生殖器部位，有時(shí)僅有1-2個(gè)皰疹，病程亦短，自發(fā)病至愈合8-12天。本病也可伴有生殖器以外部位的感染，如口唇、臂部及中樞神經(jīng)系統(tǒng)等。

皮損為紅斑基礎(chǔ)上可見(jiàn)成群的水皰或膿皰或成糜爛及潰瘍。皮膚病變也可出現(xiàn)在口唇、手指、臀部、大腿、手臂，甚至眼部與咽喉。并發(fā)腦膜炎或橫貫性脊髓炎，一般于發(fā)疹后3-12天出現(xiàn)頸項(xiàng)強(qiáng)直等顱內(nèi)壓增高的現(xiàn)象。

潛伏感染和復(fù)發(fā)：HSV感染人體后1周左右，血中出現(xiàn)中和抗體，3-4周達(dá)高峰，可持續(xù)多年，這些抗體能清除病毒和使機(jī)體康復(fù)，但大多數(shù)個(gè)體不能有效消滅病毒，也不能阻止復(fù)發(fā)，病毒以潛伏狀態(tài)長(zhǎng)期存在宿主體內(nèi)。不同亞型HSV感染者急性首發(fā)生殖器皰疹的臨床過(guò)程相似，但生殖器病變復(fù)發(fā)率不同，首發(fā)HSV-2感染者約90%，在12個(gè)月內(nèi)會(huì)出現(xiàn)一次復(fù)發(fā)(平均復(fù)發(fā)4次)，而初次感染HSV-1者僅50%出現(xiàn)類(lèi)似復(fù)發(fā)(平均復(fù)發(fā)次數(shù)小于1)。不同個(gè)體及同一病人一生中生殖器HSV-2感染的復(fù)發(fā)率變化很大，大多數(shù)年復(fù)發(fā)5-9次，一般在原發(fā)皰疹消退后1-4個(gè)月內(nèi)發(fā)生，有些患者受到促發(fā)因素，如發(fā)熱、月經(jīng)、日曬、寒冷、某些病毒感染等的影響而復(fù)發(fā)，其特點(diǎn)是每次復(fù)發(fā)往往發(fā)生在同一部位，復(fù)發(fā)前可有前驅(qū)癥狀如局部瘙癢，發(fā)疹前數(shù)小時(shí)感染部位有灼燒，麻刺感。