（一）小陰莖的檢查方法：

常規(guī)檢查染色體核型、血糖、鉀、鈉測定或生長激素有關(guān)的激素檢查及甲狀腺功能測定。對LH、FSH、睪酮低者，應懷疑原發(fā)性睪丸功能低下，可做人絨毛膜促性腺激素（HCG）刺激試驗（隔天肌注HCG 1000～1500U，共7次，最后1次注射后24～48h內(nèi)查血清睪酮）。如睪酮、LH、FSH均<3.45nmol/L，則睪丸功能不足；如睪酮、LH、FSH均低，則做促性腺激素釋放激素刺激試驗，以鑒定腺垂體功能。

影像學檢查：有條件者應把磁共振MRI作為常規(guī)檢查。主要檢查腦部有無下丘腦、垂體畸形。對有顱面部異常者應注意視神經(jīng)交叉、第四腦室及胼胝體有無異常。

（二）小陰莖的鑒別診斷：

1、 假陰莖短小癥：指陰莖在非勃起狀態(tài)下，雖然長度小于3cm，但在勃起狀態(tài)下卻能顯著地延長、增粗2~3倍，且不影響性生活。

2、 潛伏陰莖：指陰莖雖貌似短小，但用手向后推壓陰莖旁皮膚時，可露出正常大小的陰莖。

3、 天宦：陰莖短小，且睪丸及男性第二副性征發(fā)育不全，染色體組型為47，XXY等。

4、 陰莖陰囊融全（蹼形陰莖）：指陰囊皮膚向前擴展呈薄皺壁樣達陰莖腹側(cè)，成年后影響性生活者為蹼形陰莖。

5、 縮陽癥：男性會覺得自己的陰莖在不斷縮小，甚至縮入腹內(nèi)，從而產(chǎn)生一種恐懼，是一種癔病。其不發(fā)病時如常人，陰莖及副性征發(fā)育均正常。

6、陰囊橡皮腫：陰囊過度腫脹，陰莖埋入其中。但有絲蟲病感染史，陰囊皮膚增厚，粗糙有皸裂，有時累及股部及下肢皮膚。

7、隱匿陰莖：陰莖發(fā)育不全，隱匿在皮下，似小陰莖。但病人肥胖，皮下脂肪很厚，陰莖埋沒于包皮與恥骨區(qū)皮下脂肪組織內(nèi)。

（三）小陰莖的自我檢測方法：

用手盡量拉直陰莖，測量恥骨聯(lián)合至陰莖頭頂端的距離為陰莖長度。陰莖長度小于正常陰莖長度平均值2.5個標準差以上時，即可診斷為小陰莖。