肛瘺形成初期是以膿腫、炎癥為主，炎癥消退，瘺道逐漸形成，局部癥狀逐漸減輕。但復(fù)雜性肛瘺或有急性感染時(shí)，局部有明顯的炎癥反應(yīng)，并伴有全身癥狀。

　　1.流膿 是肛瘺的主要癥狀，膿液多少與瘺管長(zhǎng)短和多少有關(guān)，新生成的瘺管，炎癥反應(yīng)大，流膿較多，膿液粘稠、黃色、有臭味；時(shí)間長(zhǎng)久的排膿較少，或時(shí)有時(shí)無(wú)，膿液白色，稀淡如水；如忽然膿液增多，表示有新管生成。有時(shí)瘺口暫時(shí)封閉，不排膿液，可出現(xiàn)局部腫痛或體溫上升，封閉的瘺口又排膿。有的外口可排氣體和糞便。內(nèi)瘺常有膿血由肛門(mén)排出，由于膿性分泌物不斷反復(fù)流出，患者常感到肛門(mén)處濕潤(rùn)、內(nèi)褲不凈，給生活帶來(lái)很大麻煩。與其他器官相通的瘺管有特殊癥狀。

　　2.疼痛 瘺管通暢無(wú)炎癥時(shí)常不感疼痛，只感覺(jué)局部發(fā)脹和不適，行走時(shí)加重。當(dāng)瘺管感染或膿液排出不暢而腫脹發(fā)炎時(shí)，可引起疼痛。內(nèi)瘺時(shí)常感到直腸下部和肛門(mén)部灼熱不適，排糞時(shí)感到疼痛。

　　3.瘙癢 由于膿液不斷刺激肛周皮膚，常感覺(jué)瘙癢，肛周潮濕不適，皮膚變色、表皮脫落，纖維組織增生和增厚，有時(shí)形成濕疹。

　　4.排便不暢 復(fù)雜性肛瘺口久不愈，可引起肛門(mén)直腸周?chē)纬纱蟮睦w維化瘢痕或環(huán)狀的條索，影響肛門(mén)的舒張和閉合，大便時(shí)感到困難，有便意不盡的感覺(jué)。

　　5.全身癥狀 在急性炎癥期和復(fù)雜性肛瘺反復(fù)發(fā)作時(shí)，可出現(xiàn)不同程度的發(fā)熱、或伴有消瘦、貧血、體虛等長(zhǎng)期慢性消耗癥狀。