肝穿刺活體組織檢查對肝病的診斷和預后是有價值的，危險性極小。操作在局麻下施行，病人僅有輕度不適。目前臨床應用的負壓吸引技術在超聲波的指導下實施，簡單、安全，已在臨床上廣泛應用。

（l）用于肝內外疾病的鑒別診斷：肝脾腫大、肝區(qū)痛、肝功能異常影像檢查，很難與病毒性肝炎區(qū)別，此時應進行肝穿刺。癥狀不多，但黃疸明顯，肝臟亦明顯腫大，甲胎蛋白檢測滴度較高，堿性磷酸酶或轉肽酶滴度很高，此時亦應進行肝穿刺明確診斷。

（2）鑒別黃疸的性質和原因：病史、臨床實驗室檢查后仍不能確定黃疸的病因時可以作肝臟活體組織檢查。Gilbert氏病，Dubin-Johnson氏綜合征，Rotor氏綜合癥等，可經(jīng)肝穿刺而確診。但需指出，深度黃疸患者作肝穿刺是有危險的，只在觀察治療8周后診斷仍不十分明確時，才考慮作肝臟活體組織檢查。

（3）鑒別肝炎的臨床類型：慢性肝炎的病理分類，單靠臨床難以分清，但它們的預后不一樣。慢性活動性肝炎和早期肝硬變的鑒別也很困難，慢性活動性肝炎經(jīng)適當調治，病變是可逆轉的，若肝硬變出現(xiàn)，是難以逆轉的。病毒性肝炎而又無明確的實驗室指標時，肝穿刺活檢能提供明確的病理診斷以指導臨床治療及預后的判斷。

（4）作為判斷藥物治療效果的指標：藥物的療效不能單憑患者主觀感覺，化驗檢查也受各種技術因素的影響，而肝穿刺提供的肝組織依據(jù)比較客觀確切。

（5）明確酒精性肝硬化的診斷與分期：其檢查結果常具有特征性，而且可發(fā)現(xiàn)不可逆性肝纖維化與可逆性炎癥的程度。

（6）診斷肝臟肉芽腫病變和其他病變：如肝結核、波浪熱、組織胞漿菌病、球孢子菌病、黃疸出血型鉤端螺旋體病及肝阿米巴病、立克次氏體病、蠕蟲病等。

（7）診斷肝臟有無浸潤性病變以及某些代謝性病變，如肝臟腫瘤、肝糖元累積病、肝臟淀粉樣變性、單核巨噬系統(tǒng)疾病、肝豆狀核變性、血色病等。