子宮內膜異位癥患者常伴不孕，并已成為不孕的重要原因之一，據國外文獻報道，在不孕者中，35%～51%為子宮內膜異位癥，而在子宮內膜異位癥患者中不孕發(fā)生率為30%～75%。

子宮內膜異位癥導致不孕的原因主要是由于內膜異位癥造成盆腔粘連，輸卵管及卵巢周圍的粘連使輸卵管功能及卵巢功能發(fā)生障礙，輸卵管粘連使拾卵機制及精子的輸卵管內輸送發(fā)生障礙而不孕，雖然在內膜異位癥的病變過程中輸卵管多保持通暢，但Muse報道，在嚴重的子宮內膜異位癥的婦女中7%輸卵管阻塞，也致不孕，內膜異位灶的破壞，使卵巢的功能發(fā)生障礙，可引起有或無高催乳素血癥的無排卵性周期，黃體功能不全，黃素化未破裂卵泡綜合征等。

除此外還認為內膜異位癥患者免疫功能的異常，也是導致不孕的原因，認為內膜異位癥患者盆腔非特異性的炎癥反應可激活巨噬細胞，并產生各種細胞因子，腹腔內巨噬細胞增多，可吞噬精子和干擾卵細胞的分裂致不孕，患者體內B淋巴細胞所產生的抗子宮內膜抗體可干擾早期受精卵的輸送和著床，子宮直腸陷凹分泌量的增加，前列腺素的增多和（或）腹水中的巨噬細胞和T淋巴細胞活性增加，使精子-卵母細胞之間的相互作用以及輸卵管能動性和（或）卵巢的功能障礙而致不孕，患者由于性交疼痛，使性交頻率相應減少，使受孕機會也減少。