病史和癥狀能給不明原因發(fā)熱提供重要線索，旅游，接觸過某種物品或動物等信息也很重要。例如美國某些地區(qū)是球孢子菌病和組織漿胞菌病地方性流行區(qū)域，傷寒可能有飲用不潔水的病史，布氏菌病有在肉類加工廠工作史等。在不明原因發(fā)熱，熱型一般無診斷價值，但也有例外。隔天發(fā)熱或每3天一次發(fā)熱提示瘧疾，但確診還需從血涂片中找到瘧原蟲。

在周期性中性粒細(xì)胞缺乏癥，每21天外周中性白細(xì)胞數(shù)下降到很低水平，常引起感染和發(fā)熱。對周期性發(fā)熱病人，應(yīng)懷疑霍奇金病。

全面重復(fù)的體檢，特別是皮膚，眼，甲床，淋巴結(jié)，心，腹等很重要。

實驗室檢查包括血及其他可采集到的體液的細(xì)菌，真菌，病毒和分枝桿菌的分離培養(yǎng)，全部血球計數(shù)和抗體滴定（如傷寒，布氏菌病和某些病毒?。δ承┘膊。ㄈ绺腥拘孕膬?nèi)膜炎）的診斷，可能需要多次采血，如一天2~3次，進(jìn)行分離培養(yǎng)；對原蟲病（如瘧疾）的確診需進(jìn)行血液的直接檢查，抗體滴度的升高可診斷很多傳染病，但血清標(biāo)本采集的間隔應(yīng)有規(guī)律。近年建立的新的，更特異的免疫學(xué)和分子生物學(xué)技術(shù)（如PCR）可能也有助于診斷。此外，厭氧菌感染已日益受到關(guān)注，由于其要求厭氧或低氧的培養(yǎng)環(huán)境方可發(fā)現(xiàn)，特別是專性厭氧菌（如破傷風(fēng)桿菌）和微需氧菌（如幽門螺桿菌）引起的感染，已越來越被提高重視程度。

非損傷性措施（特別是超聲圖，CT和MRI）減少了損傷性處理的必要。超聲圖可顯示心臟的贅生物及胰，肝，腎，膀胱的異常；CT可顯示腹腔腫瘤，腹膜后，胸骨后和腸系膜淋巴結(jié)異常，也可檢查出脾，腎，腎上腺，胰，心，中膈和盆腔的缺陷；放射性核素掃描，特別是用111銦標(biāo)記粒細(xì)胞，可以幫助定位感染和觀察感染過程。在檢測大多不明原因發(fā)熱，包括神經(jīng)系統(tǒng)，MRI更優(yōu)于CT。

損傷性診斷措施也是需要的，如肝，骨髓或其他相關(guān)部位：皮膚，胸膜，淋巴結(jié)，腸，肌肉活檢?；顧z標(biāo)本應(yīng)進(jìn)行組織病理學(xué)檢查和細(xì)菌，真菌，病毒和分枝桿菌分離培養(yǎng)。在90%病例，不明原因發(fā)熱診斷方法各不相同。