寶寶發(fā)燒39度吃藥不退燒，可能隱藏的嚴重病因有感染性因素如流感病毒感染、肺炎鏈球菌感染、支原體感染，非感染性因素如川崎病、白血病等。

1. 流感病毒感染：流感病毒侵襲寶寶機體后，會在體內(nèi)大量復制，引發(fā)炎癥反應，導致高熱。寶寶感染后常表現(xiàn)為高熱、乏力、頭痛、肌肉酸痛等。治療上可使用奧司他韋、扎那米韋、帕拉米韋等抗病毒藥物，需遵醫(yī)囑使用。

2. 肺炎鏈球菌感染：肺炎鏈球菌可引起肺炎、中耳炎等多種疾病。當感染肺部時，炎癥刺激會使體溫調(diào)節(jié)中樞紊亂，出現(xiàn)持續(xù)高燒。癥狀可能有咳嗽、咳痰、呼吸急促等。治療可選用青霉素類、頭孢菌素類、大環(huán)內(nèi)酯類等抗生素，具體用藥要遵醫(yī)囑。

3. 支原體感染：支原體感染人體后，會黏附在呼吸道或泌尿生殖道等部位的上皮細胞表面，引發(fā)免疫反應，導致發(fā)熱。寶寶可能有發(fā)熱、咳嗽等表現(xiàn)，咳嗽多為刺激性干咳。治療常用阿奇霉素、紅霉素、羅紅霉素等藥物，使用時需遵醫(yī)囑。

4. 川崎病：這是一種病因未明的幼兒高發(fā)的血管炎綜合征，免疫系統(tǒng)異常激活，導致全身血管炎癥，引起持續(xù)發(fā)熱。除了發(fā)燒，還可能有皮疹、口唇干裂、頸部淋巴結(jié)腫大等癥狀。治療上一般使用丙種球蛋白、阿司匹林等藥物，具體治療方案應遵醫(yī)囑。

5. 白血病：白血病是造血干細胞的惡性克隆性疾病，白血病細胞大量增殖，抑制正常造血，同時釋放多種細胞因子，導致發(fā)熱。寶寶可能伴有貧血、出血、肝脾淋巴結(jié)腫大等癥狀。治療通常包括化療、靶向治療等，需在醫(yī)生指導下進行。

寶寶發(fā)燒39度吃藥不退燒可能是由多種嚴重病因引起的，感染性因素和非感染性因素都不能忽視。當寶寶出現(xiàn)這種情況時，家長應密切觀察寶寶的癥狀，并及時帶寶寶到正規(guī)醫(yī)院就診，以便明確病因，采取針對性的治療措施。同時，所有藥物的使用都必須嚴格遵醫(yī)囑。