1、時間隨意性

沒有按足夠療程治療，看到病甲在好轉，就過早停藥，影響療效。

2、真菌多樣性

已知29種真菌（13種皮膚癬菌，10種酵母菌和6種霉菌）都能入侵甲板，感染灰指甲。

3、藥物局限性

絕大部分藥物，都不能抑制所有真菌生長。

4、真菌休眠體（孢子）不敏感性

常規(guī)藥物往往只能殺死真菌菌絲，無法殺死處于靜止休眠狀態(tài)的真菌體（孢子），它潛伏期長，一旦用藥結束后，甲板在適宜的環(huán)境下，它便會萌發(fā)、生長、繁殖，造成久治不愈。

5、病甲復雜性

部分病甲的甲板下面有癬菌瘤，抗真菌藥物不能有效穿透，難以殺滅瘤內真菌。

6、甲板致密性

甲板由180層角蛋白組成，總厚度只有0.5毫米，非常致密，一般藥物難以穿透甲板，不能徹底殺滅甲板下的真菌。

7、治療單一性

只治療灰指甲，手足癬沒有同時治療或治療不徹底，鞋襪也未消毒。